Rădăcinile rezistente la antibiotice nu semnifică rezistența la substanțe chimice. Aceste bacterii și-au dezvoltat o rezistență la antibiotice în legătură cu situațiile de spitalizare a oamenilor. Aceasta nu implică că respectivele rădăcini sunt rezistente la dezinfectarea cu substanțe chimice. Substanțele chimice sunt testate, în prezent, împotriva rădăcinilor rezistente la antibiotice, cum ar fi VRE, MRSA, etc. Acestea sunt indicate pe etichete.
Există diferite opinii în cadrul comunității științifice cu privire la dacă utilizarea excedentară a substanțelor dezinfectante poate conduce la rezistența la substanțe chimice. O cercetare efectuată la nivelul literaturii în domeniu a arătat că există mai multe studii publicate care au sugerat că anumite substanțe chimice de dezinfectare, cum ar fi compușii de amoniu cuaternar, lasă un reziduu activ pe suprafețe, care poate conduce la rezistență.
Unele produse lasă un ingredient rezidual activ pe suprafețe. Producătorii pretind că acest reziduu este important pentru activitatea biocidă continuă.
Ingredientele reziduale active lăsate de substanțele antimicrobiene sunt eficiente doar în stare umedă. Suplimentar, aceste reziduuri pot contribui la rădăcinile microorganismelor rezistente la substanțe chimice.

